Bệnh viện Đại học Y Dược Huế có thế mạnh là đội ngũ chuyên gia giàu kinh nghiệm, trong đó có không ít người đang là chuyên gia đầu ngành trong lĩnh vực Y học của Việt Nam, với thế mạnh đó, trong nhiều năm qua, Bệnh viện Đại học Y Dược Huế đã đào tạo rất nhiều kỹ thuật ngắn hạn cho các bác sĩ khu vực Miền Trung - Tây Nguyên nói riêng và toàn quốc nói chung

Các hình thức đào tạo kỹ thuật ngắn hạn của Bệnh viện Đại học Y Dược Huế:

 Đào tạo tập trung theo khoá, gồm có các khoá học sau:

1. Điện tâm đồ cơ bản và nâng cao, mỗi năm 2-3 khóa, đối tượng đào tạo: Bác sĩ đa khoa

2. Vật lý trị liệu - Phục hồi chức năng, mỗi năm 2-3 khóa, đối tượng đào tạo:Bác sĩ đa khoa, Bác sĩ Y học dự phòng, Bác sĩ Y học cổ truyền, Y sĩ đa khoa, Y sĩ Y học cổ truyền

3. Tế bào học căn bản, mỗi năm 1 khoá, đối tượng đào tạo: Bác sĩ đa khoa, Bác sỹ chuyên ngành xét nghiệm, Cử nhân Kỹ thuật Y học, Cử nhân Kỹ thuật xét nghiệm

4. Phẫu thuật nội soi TMH: mỗi năm 1 khóa, khai giảng vào tháng 2, đối tượng đào tạo: bác sĩ chuyên ngành TMH

5. Siêu âm tim, mỗi năm 1 khóa, khai giảng vào đầu tháng 3, đối tượng đào tạo: Bác sĩ đa khoa

6. Siêu âm sản phụ khoa, mỗi năm 1 khóa, khai giảng vào đầu tháng 3, đối tượng đào tạo: Bác sĩ đa khoa

7. Quản lý điều dưỡng, khai giảng đầu tháng 9, đối tượng đào tạo: điều dưỡng các hệ từ trung cấp trở lên

8.Siêu âm bụng tổng quát, mỗi năm 1 khóa, khai giảng đầu tháng 9, đối tượng đào tạo: bác sĩ đa khoa, bác sĩ siêu âm do các đơn vị cử đi học, đang không phải là học viên theo học tại trường hay bệnh viện trường Đại học Y Dược Huế

Đào tạo theo hình thức Cầm tay chỉ việc:

Bệnh viện Trường Đại học Y Dược Huế đào tạo theo hình thức Cầm tay chỉ việc đối với các thủ thuật phức tạp, yêu cầu thời gian thực hành cao như: Can thiệp tim mạch, Phụ can thiệp tim mạch, Kỹ thuật tán sỏi ngoài cơ thể điều trị sỏi tiết niệu, nội soi tiêu hoá cơ bản và nâng cao...